拥有丰富潜水经验的弗兰克·麦克盖尔数月以来都在南太平洋的沿岸几内亚的埃萨阿拉附近潜水探险，兼带进行一些洞穴探险。不过这些小打小闹的探险无法满足麦克盖尔的雄心壮志，因为当地有一个尚未被探明的巨大洞穴。这个被人尊称为“洞穴之母”的洞穴是世界上最大、最深、结构最为复杂、最危险，也是最雄伟、最美丽的洞穴。为了成为名垂历史的探险家，并创造人类洞穴潜水的世界纪录，麦克盖尔拉来了投资，找来了一批精兵强将，准备下洞穴探险。　　开始的一切非常顺利，所有的队员都显示出了良好的专业素质，所有的装备都是顶级的，所有的计划看上去都天衣无缝。不过随着探险小队的深入，大自然开始渐渐发威－－路越来越狭窄、水流越来越湍急、水下的地形也越来越复杂。这时候，几内亚计入了雨季，强热带风暴袭击了这个国家。连续的大雨致使河水上涨，地下的水位也随之上升。雨水倒灌进洞穴深处，在地底形成了“洪水”。巨大的洪水成为了探险小组的障碍，在失去几名队员之后，麦克盖尔和队内的乔什以及他们的资助人卡尔·何雷面对着食物和饮用水的短缺，不得不改变原先走回洞口的逃生计划。他们只有通过潜水的方法，在复杂如迷宫搬的洞穴水体中，找到通往海洋的道路。　　这时候，麦克盖尔不得不去思考一个问题，那就是主宰着人类性命的什么？是人类自己还是伟大的自然的伟力？或许在洞穴的处境里，人类只是匆匆而渺小的过客。